ステータスコードとLocationヘッダーを順番に追い、循環を作る規則を特定します。ホスト名、HTTP・HTTPS、末尾スラッシュ、ログイン経路などで逆方向に送る設定を調べます。
CloudflareのFlexibleモードはオリジンサーバーへHTTPで接続します。オリジンがその要求をHTTPSへ戻すとループになり得ます。一方、Always Use HTTPSとオリジンのHTTP→HTTPS設定を併用しただけで必ず発生するわけではありません。
原因を特定してTLS接続と移動規則をそろえます。修正後は最終応答と内部リンクを再確認し、Search Consoleやログで取得の回復を追います。影響は範囲、継続時間、再取得時期などによって変わります。